两次大加热之间的设备运行周期与许多因素有关。从操作的角度来看，这主要取决于主热交换器的空气通道何时被堵塞。堵塞的主要原因是进入设备的空气中的水分和二氧化碳含量超过标准，其在主热交换器中积聚并冻结直至堵塞。
分子筛纯化系统的异常运行会导致设备的运行周期缩短。主要是由于以下原因造成的：
1.分子筛吸附床发生短路。在运行过程中，由于不稳定的气速控制或切换时两个储罐之间的压力差过大，会对床层产生影响，使分子筛床不均匀，并使床层短路。在严重的情况下，吸附器的防尘网会破裂，分子筛粉会进入热交换器通道，造成堵塞；
2.喷淋冷却塔带水。穿过喷雾冷却塔的空气速度过高，这会使水雾进入吸附器，从而大大增加了吸附器去除水的负荷。出口空气中的水分和二氧化碳含量超过了标准，被带入主热交换器并冻结，使电阻增加。如果冷段的阻力增加，则二氧化碳冻结。如果高温部分的电阻增加，则水分冻结。整个热交换器的阻力增加，它们都被冻结，或者分子筛粉被堵塞。
3.冷水机工作异常，导致冷水温度升高，无法将空气冷却至常温。一方面，离开喷雾塔的空气中的饱和水含量增加；另一方面，分子筛的吸附能力降低。
4.喷雾塔被切断或水位太高，会导致分子筛吸附器的温度升高，或引起载水事故。
